A figura à esquerda demonstra os aspectos fundamentais do esqueleto ósseo de um pinguim. Embora o bico pareça ser parte do sistema esquelético, não é. O bico do pinguim é uma estrutura de queratina, não hidroxiapatita. A estrutura molecular do bico é espessa e compacta e está ligada ao pré-maxila do pingüim. Os ossos pré-maxilares estão ligados a uma porção do crânio que contém um dos órgãos mais importantes do pingüim: o cérebro (o centro de coordenação).
A terminação do crânio liga-se as vértebras cervicais não directamente articuladas com a base do crânio, no entanto, eles estão unidos através de vários ligamentos, que é o tecido conjuntivo denso e resistente. Existem várias vértebras cervicais, além do primeiro, cada vértebra se articula com uma vértebra acima e abaixo dela. As vértebras cervicais mudaram sua morfologia e ficaram conhecidas como as vértebras torácicas. Este é o local onde a caixa torácica "começa". A cabeça de cada costela articula-se com uma vértebra torácica. As numerosas costelas formam um escudo protetor para os órgãos internos.
Os ossos torácicos mais elaborados são os mais ventrais: o esterno e quilha. Note que estes ossos são extraordinariamente grandes. Os músculos peitorais anexam à quilha do esterno e se estendem até o úmero do membro superior. Por que isso é esterno tão grande? Pássaros voam, e para voar, eles precisam de músculos grandes e poderosos particularmente peitoral. No caso dos pingüins, eles não voam, mas nadam e também exigem grandes músculos peitorais.O Esterno e as quilhas dos pingüins são grandes também. O peitoral é o músculo depressor primário, e corre em sentido ventromedial à quilha do úmero. O músculo elevador principal do pingüim é o que corre supracoracoide dorsomedialmente ao úmero, a articulação da clavícula e osso coracóide. Em pinguins, toda estrutura de voô é conhecida como o cinto peitoral.
Os membros do pingüim são similares na estrutura esqueletica e no fornecimento de sangue e compartimentalização muscular. Cada uma das extremidades (membros) é composta de um osso singular (= úmero do membro superior; fêmur = inferior) aproximamente com dois ossos intermediários (rádio e ulna = membro superior; tibiotarso e fíbula membro = inferior), metacarpos (membro superior) ou metatarsos (membros inferiores) e falanges distais. Em pinguins, não se pode vê geralmente o fêmur (coxa) e nem o joelho, uma vez que está enterrada abaixo das penas. A última estrutura é o púbis. O pubis de um pingüim é uma estrutura interessante quando é comparado com o púbis de um dinossauro. Nos pinguins, uma das pontas está direcionada à cabeça, já nos dinossauros, uma das pontas está direcionada para a cauda. Esta mudança evolutiva observada em aves (e alguns dinossauros avançado) é chamado o púbis inversa. Para finalizar e concluir, na figura acima destaca-se a patella confirmando a presença do joelho nos pinguíns e aves de forma geral.
